Primavera 1945: quando a Los Alamos, nel deserto del New Mexico, sta per essere messa a punto la prima bomba atomica, un agente viene trovato assassinato vicino a Santa Fe. Michael Connolly, ufficiale dell'”intelligence” militare, viene chiamato a investigare e si trova a dipanare un complesso intreccio di legami passati, abitudini sessuali devianti e lealtà in conflitto, che caratterizza Los Alamos, un mondo d’ombra dove la realtà e la morale sono completamente distorte, e dove superare i confini della scienza è più importante che scoprire la verità.